برای درک تولید اتانول، ابتدا در مورد آنزیم ها و نقش آنها در شکستن سلولز و نشاسته به گلوکز، به طوری که تخمیر می تواند رخ دهد باید اطلاعاتی داشته باشیم. آنزیم ها مرحله اول هستند اما چندین مرحله برای تولید اتانول وجود دارد.

ابتدا نیشکر به وسیله کامیون یا راه آهن به کارخانه اتانول تحویل داده می شود و در انبارهای ذخیره شده قرار داده شده و برای تامین گیاه برای ۷-۱۰ روز نگهداری شود.  در ابتدای فرآیند تولید، نیشکر ها توسط غلتک هایی خرد شده و برای تخمیر آماده می شود. نیشکرها مخلوط با آب فرآوری شده و آنزیم آلفا آمیلاز اضافه می شود. برای تخلیه ویسکوزیته به مدت ۳۰-۴۵ دقیقه به مدت ۱۸۰-۹۰ درجه فارنهایت گرم می شود. این دوغاب از طریق فرایندهای مایع سازی اولیه و ثانویه به منظور تخریب نشاسته به دگزامتین زنجیره کوتاه می رود. گلوکومیلاز به عنوان مخلوط به مخزن تخمیر تلقی می شود. هنگامی که داخل مخازن تخمیر قرار می گیرد، مخلوط به عنوان مخلوط اشاره می شود. آنزیم گلوکوآمیلاز باعث انقباض دکسترین برای تشکیل قندهای ساده می شود. مخمر برای تبدیل قند به اتانول و دی اکسید کربن اضافه شده است. پس از آن مجددا ۵۰ تا ۶۰ ساعت تخمیر می شود و منجر به مخلوطی حاوی ۱۵ درصد اتانول و همچنین جامدات از دانه و افزودن مخمر می شود. مخلوط تخمیر شده به یک سیستم تقطیر چند ستون که در آن حرارت اضافی اضافه می شود، پمپ می شود. تا زمانی که جریان محصول آماده است تا ستون تقطیر را ترک کند، حاوی ۹۵٪ اتانول به حجم (۱۹۰ برابر) است. اتانول ۱۹۰ باقی مانده حاوی حدود ۵٪ آب است. از طریق یک غربال مولکولی عبور می کند تا آب باقی مانده از اتانول را بر اساس اندازه های مختلف مولکول جدا کند. این مرحله، اتانول بی آب (بدون آب) ۲۰۰ برابر را تولید می کند. قبل از اتانول به تانک های ذخیره شده ارسال می شود، مقدار کمی از denaturant اضافه می شود، و آن را برای مصرف انسان مناسب نیست. بیشتر تانک های ذخیره سازی گیاهان اتانول به اندازه کافی برای ذخیره سازی ظرفیت تولید ۷ تا ۱۰ روز ذخیره می شوند.